La Plateforme de Biologie Moléculaire a été créée en 2006. Elle fait l'objet d'une collaboration étroite entre les établissements du Centre Hospitalier Universitaire de Lille (CHU) et du Centre Oscar Lambret (COL). Elle permet aux équipes de ces établissements de réaliser des tests innovants dans le cadre du traitement contre le cancer.
Objectifs et tests au sein de la Plateforme de Biologie Moléculaire
Les analyses réalisées au sein de la Plateforme de Biologie Moléculaire ont pour but d'améliorer les diagnostics et les traitements proposés aux patients atteints de tumeurs cancéreuses.
Les principaux objectifs de la Plateforme de Biologie Moléculaire sont donc les suivants :
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Affinage du diagnostic,
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Meilleure stratification des patients,
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Identification des marqueurs moléculaires permettant de proposer un traitement personnalisé :
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prescription d'inhibiteurs de tyrosines kinases,prescription d'inhibiteurs de PARP (cancer des ovaires), immunothérapie,
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Suivi de la masse tumorale et de la survenue de résistances après traitement,,
Mise en œuvre
L'analyse de tissus tumoraux par les équipes de la Plateforme de Biologie Moléculaire est le résultat d'une étroite collaboration entre différents partenaires :
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Ce processus débute par une demande de test de la part du clinicien en charge du patient. Cette demande peut être issue d'un Centre Hospitalier, Centre Hospitalier Universitaire, Centre de Lutte contre le Cancer ou Clinique.
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Le médecin pathologiste, en charge du diagnostic, qui sélectionnera l'échantillon de tumeur et l'enverra au Centre de Pathologie moléculaire adossé à la Plateforme.
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Celui-ci va réaliser un premier traitement de l'échantillon en effectuant un contrôle morphologique et des coupes qui seront transmises à la Plateforme de Biologie Moléculaire.
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Enfin, la recherche de marqueurs moléculaires sera réalisée et les résultats seront transmis aux différents acteurs médicaux : cliniciens, pathologistes et équipes du Centre de Pathologie Moléculaire.
Une approche multidisciplinaire - Collaboration étroite entre les différents partenaires :
Patients et pathologies
Les tests réalisés au sein de la Plateforme de Biologie Moléculaire servent à déterminer l'accès à des thérapies ciblées grâce à l'analyse des biomarqueurs qui orienteront la stratégie de traitement.
Ces analyses peuvent donc concerner des patients pris en charge dans divers types d'établissements :
- Demandes émanant d'établissements publics ou privés,
- Accessible à tous les patients des Hauts-de-France,
- Concerne également certains tests de recours nationaux.
Publics concernés
Au sein de la Plateforme de Biologie Moléculaire, les analyses peuvent êtres réalisées sur les tumeurs solides, et les tumeurs hématopoïétiques.
En fonction du type de tumeur, les résultats pourront informer sur le diagnostic, le traitement à privilégier ou encore apporter des éléments pronostiques :
Hémopathies malignes
Leucémies aigües lymphoblastiques et myéloblastiques
Syndrome myélodysplasique
Leucémie myéloïde chronique
Maladie résiduelle
Biologie Moléculaire des tumeurs hématopoïétiques
Compétences mutualisées
La mise en œuvre de la Plateforme de Biologie Moléculaire requiert un haut niveau d'expertise et de technologie permis par la collaboration étroite entre le Centre Hospitalier Universitaire de Lille (CHU) et le Centre Oscar Lambret (COL):
Des équipes de biologie et pathologie moléculaire
Équipes du COL :
Équipes du CHU :
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Unité de Biologie moléculaire des hémopathies malignes
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Unité de Biologie moléculaire des tumeurs solides
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Unité de Cytogénétique oncohématologie
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Unité de Pathologie moléculaire
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Unité d'Oncologie Moléculaire Humaine
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Unité de Pathologie Morphologique et Moléculaire
Une grande diversité d'outils
Séquençage capillaire,
Séquençage nouvelle génération (NGS),
PCR digitale (dPCR),
PCR temps réel,
CGH array,
Pyroséquençage,
nCounter analyser,
FISH
séquençage Sanger : SNV
analyse de fragments : indel, CNV
SNV, indel, CNV, fusions, méthylation ADN
SNV faible fréquence allélique,
CNV, SNV, transcrits de fusion
analyse comparative sur puces ADN : CNV
méthylation ADN
SNV, transcrits de fusion
expression ARN
transcrits de fusion
CNV, translocations
